Сезон 1986/87, Купа на УЕФА – изиграва два велики мача срещу испанския гранд Барселона и е елиминиран след две равенства 1 – 1 и 0 – 0 по правилото за повече отбелязани голове на чужд терен.
Сезон 1987/88, Купа на УЕФА – за първи път Флямуртари елиминира съперник в евротурнирите. Това става в първия кръг на турнира, където е отстранен сръбският гранд Партизан Белград 2 – 0 и 1 – 2. Във втория кръг Флямуртари преодолява Визмут Ауе (сега Ерцгебирге Ауе) от ГДР след 2 – 0 като домакин и 0 – 1 като гост. В третия кръг съперник е отново Барселона. В първия мач Флямуртари постига историческа победа с 1 – 0, но на реванша губи с 1 – 4 и отпада с общ резултат 2 – 4.
Сезон 1988/89, КНК – елиминиран е в първия кръг от Лех Познан (Полша) с резултати 2 – 3 и 0 – 1.
Сезон 1990/91, КНК – отново отпадане в първия кръг, този път от гръцкия ФК Олимпиакос (0 – 2 и 1 – 3)
Сезон 1991/92, Шампионска лига – отпада от шведския шампион ИФК Гьотеборг след 1 – 1 като домакин и 0 – 0 като гост.
Сезон 1996/97, Купа на УЕФА – отпада в квалификационния кръг от Хумене (Словакия)-0-2 и 0 – 1.
КС „Флямуртари“ (Вльора)
Шампион (1): 1990 – 91
