През 1990 г. ЦСКА (Москва) създава свой женски футболен клуб под името ЦСКА-Трансекспо. Тимът се включва в съветската Първа лига и печели своята зона. Във финалния етап „армейките“ остават трети. През 1992 тимът се преименува на ЦСКА-Новая инициатива и участва във Висшата дивизия на Русия, където остава едва 11-и. На следващата година ЦСКА се класира на 9-а позиция, но поради финансова криза отборът е разформирован.
През 2014 г. отборът е възстановен на основата на ЖФК Виктория. От 2016 г. ЦСКА отново е в руския футболен елит.
