Направо към съдържанието

SARS-CoV-2: Разлика между версии

от Уикипедия, свободната енциклопедия
Изтрито е съдържание Добавено е съдържание
Ichernev (беседа | приноси)
Създадена чрез превод на страницата „Novel coronavirus (2019-nCoV)
(Няма разлика)

Версия от 16:00, 6 февруари 2020

Новият коронавирус 2019 (временно наречен 2019-nCoV),[1] неофициално известен като коронавирус Wuhan,[2] е заразен вирус, който причинява острата респираторна болест 2019-nCoV. Това е причината за продължаващата епидемия от коронавирус в Ухан 2019–20 . [3] Геномното секвениране показа, че това е позитивен едноверижен РНК коронавирус.[4][5][6]

Много ранни случаи бяха свързани с голям пазар на морски дарове и животни, а вирусът се смята, че има зоонотичен произход.[7][8] Сравненията на генетичните последователности на този вирус и други вирусни проби са показали прилики с SARS-CoV (79,5%)[9] и коронавирусите при прилепите (96%), което ги прави и най-вероятният източник.[10][11] Анализът на геномите, базиран на машинно обучение, също предполага асоциации между 2019-nCoV и бетакоронавирусите при прилепите.[12]

Първата известна инфекция при хората се появява в началото на декември 2019 г.[13][14] Епидемия от 2019-nCoV бе открита за първи път в Ухан, Китай, в средата на декември 2019 г., вероятно произхождаща от едно заразено животно. Впоследствие вирусът се разпространи във всички провинции на Китай и в повече от 25 други страни в Азия, Европа, Северна Америка и Океания. [15] Разпространението на вируса от човек на човек е потвърдено във всички тези региони.[16][17][18][19]

На 30 януари 2020 г. 2019-nCoV бе обявен за световна здравна заплаха от Световната здравна организация (СЗО).[20][21][22] Към 6 февруари 2020 (06:00 UTC) има 28 280 потвърдени случаи на инфекция, от които 28 023 в континентален Китай.[15] Към днешна дата приблизително една пета от диагностицираните случаи водят до сериозни заболявания.[23] Почти всички случаи извън Китай са се появили при хора, които или са пътували от Ухан, или са били в пряк контакт с някой, който е пътувал от района.[24]

Общата смъртност и заболеваемост вследствие на инфекция от 2019-nCoV са неизвестни, както поради факта, че коефициента на смъртност може да се променят с течение на времето в сегашното огнище, така и поради това, че броят на леките и асимптоматични случаи, които не водят до диагноза, остава неясен.[25][26] Предварителните изследвания обаче доведоха до смъртност от 2,9% и 14,6%.[27][28] СЗО предположи, че степента на смъртност е приблизително 3%.[29] Общият брой на смъртните случаи, причинени от вируса, е 565 към 6 февруари 2020 г. (06:00 UTC), почти всички в провинция Хубей.[15]

Вирусология

Инфекция

Предаването на вируса от човек на човек е потвърдено.[16] Коронавирусите се разпространяват главно чрез близък контакт, по-специално чрез въздушно-капков път от кашлица и кихане на разстояние от около 6 ft (1,8 m).[30][31] Вирусната РНК е открита и в проби от изпражнения на заразени пациенти.[32] Възможно е вирусът да е зарáзен дори по време на инкубационния период, но това не е доказано[33] и СЗО заявява, че „предаването от асимптоматични случаи вероятно не е основен двигател на разпространението“.

Базовия коефициент на репродукция (, произнесено R-нула)[34] на вируса е оценен между 1.4 и 3.9.[35][36][37][38][39] Това означава, че ако не бъдат взети мерки вирусът обикновено води до 1,4 до 3,9 нови случая за всяка установена инфекция. Установено е, че вирусът е в състояние да се предаде по верига от най-малко четирима души.[40]

Посредник

Предполага се, че животните, продавани за храна, са посредникът, защото много от първите идентифицирани заразени лица са работници на пазара на морски дарове в Хуана. Следователно, те са имали по-голям контакт с животни. Пазар, продаващ живи животни за храна, също беше обвинен в SARS епидемията от 2003 г.; такива пазари се считат за инкубатори за нови патогени.[41] Избухването предизвика временна забрана за търговия и консумация на диви животни в Китай. Някои изследователи обаче предполагат, че пазарът на морски дарове в Хуанан може да не е първоизточника на предаване на вируса към хората.[14][42]

С достатъчен брой секвенирани геноми е възможно да се реконструира филогенетично дърво от историята на мутациите на семейство вируси. Изследванията за произхода на епидемията от SARS през 2003 г. доведоха до откриването на много коронавируси наподобяващи SARS при прилепите, най-често произхождащи от рода Rhinolophus на подковите прилепи. 2019-nCoV попада в тази категория коронавируси, свързани с SARS. Две последователности на генома от Rhinolophus sinicus, публикувани през 2015 и 2017 г., показват прилика от 80% с 2019-nCoV.[10] Трети вирусен геном от Rhinolophus affinis, "RaTG13", открит в провинция Юнан, има 96% прилика с 2019-nCoV.[43][44] За сравнение, това количество вариация сред вирусите е подобно на количеството мутация, наблюдавано за десет години в щама на вируса на грипа на човешки грип H3N2.[45]

Филогенетика и таксономия

Шаблон:Infobox genome 2019-nCoV принадлежи към широкото семейство от вируси, известни като коронавируси; "nCoV" е стандартният термин, използван за обозначаване на нови коронавируси до избора на по-конкретно наименование. Това е позитивен едноверижен РНК (+ssRNA). Други коронавируси са в състояние да причинят заболявания, вариращи от настинка до по-тежки заболявания като респираторен синдром от близкия изток (MERS) и Тежкия остър респираторен синдром (SARS). Това е седмият известен коронавирус, който заразява хората след 229E, NL63, OC43, HKU1, MERS-CoV и SARS-CoV.[46]

Макар и генетично да се различава от другите коронавируси, които заразяват хора, той подобно на SARS-CoV, е член на подрода Сарбековирус (Beta-CoV линия B).[47] Нейната РНК последователност е дълга приблизително 30 000 бази.[6]

До 12 януари пет генома на 2019-nCoV бяха изолирани от Ухан и докладвани от Китайския център за контрол и превенция на заболяванията (CCDC) и други институции;[6][48][49] броят на геномите се увеличи до 28 към 26 януари. С изключение на най-ранния GenBank геном, геномите са под ембарго в GISAID. Филогенен анализ на пробите е на разположение чрез Nextstrain.[50]

Търсене на Ваксина

През януари 2020 г. няколко организации и институции започнаха работа по създаването на ваксини за 2019-nCoV на базата на публикувания геном.

В Китай Китайският център за контрол и превенция на заболяванията разработва ваксина срещу новия коронавирус.[51][52] Екипът на Yuen Kwok-yung от Университета в Хонконг, който по-рано участва в работата по коронавируса на SARS по време на епидемията през 2003 г., също обяви, че там се разработва ваксина, но още не са пристъпили към тестване при животни.[53] Източна болница в Шанхай също разработва ваксина в партньорство с биотехнологичната компания Stemirna Therapeutics.[54]

Извън китай три проекта за разработване на ваксина се подкрепят от Коалицията за иновации и подготвеност за епидемии (CEPI), включително проекти на биотехнологичните компании Moderna и Inovio Pharmaceuticals и още един от Университета на Куинсланд. Националните здравни институти на САЩ (NIH) си сътрудничат с Moderna за създаване на РНК ваксина, прилягаща на неравност по повърхността на коронавируса и се надява да започне производството до май 2020 г. Inovio Pharmaceuticals разработва ваксинация на базата на ДНК и си сътрудничи с китайска фирма, за да ускори приемането й от регулаторните органи в Китай, надявайки се да извърши изпитания на ваксината върху хора през лятото на 2020 г.[55] В Австралия Университетът на Куинсланд изследва потенциала на ваксина с молекулярна скоба, която модифицира вирусни протеини, така че да имитират коронавируса и да стимулира имунната реакция.

В независим проект Агенцията за обществено здраве на Канада предостави разрешение на Международния ваксинен център (VIDO-InterVac) в Университета в Саскачеван да започне работа по ваксина.[56] VIDO-InterVac има за цел да започне производство и тестване на животни през март 2020 г., а изпитванията върху хора през 2021 г.

Медицинският факултет на Империалския колеж в Лондон има финансиране за разработване на ваксина и провеждане на тестове върху животни. Тези два етапа се очаква да приключат към средата на февруари 2020 г.[57]

Наименование

Вирусът често е бил наричан „коронавирусът“ или „новият коронавирус“, докато СЗО препоръчва временно обозначаване „2019-nCoV“. Заради опасения, че липсата на официално име е довело до използването на предразсъдъчни неформални имена, Международният комитет по таксономия на вирусите (ICTV) обяви, че ще въведе подходящо официално име за вируса през втората седмица на февруари 2020 г.[58]

Препратки

  1. Novel coronavirus (2019-nCoV), Wuhan, China // Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Посетен на 16 January 2020.
  2. Huang, Pien. How Does Wuhan Coronavirus Compare With MERS, SARS And The Common Cold? // NPR.org. Посетен на 2020-02-03. (на английски)
  3. 2019 Novel Coronavirus (2019 nCoV): Frequently Asked Questions | IDPH // www.dph.illinois.gov. Посетен на 27 January 2020.
  4. 中国疾病预防控制中心 // Chinese Center for Disease Control and Prevention. Посетен на 9 January 2020. (Грешка в записа: Неразпознат езиков код chinese)
  5. New-type coronavirus causes pneumonia in Wuhan: expert // People's Republic of China. Архивиран от оригинала на 9 January 2020. Посетен на 9 January 2020.
  6. а б в CoV2020 // platform.gisaid.org. Посетен на 12 January 2020.
  7. Perlman, Stanley. Another Decade, Another Coronavirus // The New England Journal of Medicine. 24 January 2020. DOI:10.1056/NEJMe2001126.
  8. Wu, Joseph T. и др. Nowcasting and forecasting the potential domestic and international spread of the 2019-nCoV outbreak originating in Wuhan, China: a modelling study // The Lancet. 31 January 2020. DOI:10.1016/S0140-6736(20)30260-9. Архивиран от оригинала на 1 February 2020.
  9. Zhou, Peng и др. A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin // Nature. 3 February 2020. DOI:10.1038/s41586-020-2012-7. с. 1–4. Архивиран от оригинала на 3 February 2020.
  10. а б Benvenuto, Domenico и др. The 2019 new Coronavirus epidemic: evidence for virus evolution // bioRxiv. 2020. DOI:10.1101/2020.01.24.915157. с. 2020.01.24.915157.
  11. Callaway, Ewen и др. Why snakes probably aren't spreading the new China virus // Nature. 23 January 2020. DOI:10.1038/d41586-020-00180-8. Архивиран от оригинала на 25 January 2020.
  12. Randhawa, Gurjit S. и др. Machine learning-based analysis of genomes suggests associations between Wuhan 2019-nCoV and bat Betacoronaviruses // bioRxiv. 2020. DOI:10.1101/2020.02.03.932350. с. 2020.02.03.932350.
  13. WHO | Novel Coronavirus – China // WHO. Посетен на 2020-02-01.
  14. а б Cohen, Jon. Wuhan seafood market may not be source of novel virus spreading globally // Science. January 2020. DOI:10.1126/science.abb0611.
  15. а б в Operations Dashboard for ArcGIS // gisanddata.maps.arcgis.com. Посетен на 2020-02-02.
  16. а б Chan, Jasper Fuk-Woo и др. A familial cluster of pneumonia associated with the 2019 novel coronavirus indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster // The Lancet 0. 24 January 2020. DOI:10.1016/S0140-6736(20)30154-9.
  17. Rothe, Camilla. Transmission of 2019-nCoV Infection from an Asymptomatic Contact in Germany // NEJM. 2020. DOI:10.1056/NEJMc2001468. с. Correspondence to the Editor Page.
  18. The Coronavirus Is Now Infecting More People Outside China // Wired. 30 January 2020.
  19. Khalik, Salma. Coronavirus: Singapore reports first cases of local transmission; 4 out of 6 new cases did not travel to China // 4 February 2020. Посетен на 5 February 2020.
  20. Coronavirus declared global health emergency // BBC News Online. Посетен на 30 January 2020.
  21. Wee, Sui-Lee. W.H.O. Declares Global Emergency as Wuhan Coronavirus Spreads // 30 January 2020. Архивиран от оригинала на 30 January 2020. Посетен на 30 January 2020.
  22. Statement on the second meeting of the International Health Regulations (2005) Emergency Committee regarding the outbreak of novel coronavirus (2019-nCoV) // World Health Organization (WHO). Посетен на 30 January 2020.
  23. Novel Coronavirus (2019-nCoV) situation reports no.8 // www.who.int. Посетен на 2020-02-01. (на английски)
  24. Germany confirms seventh coronavirus case // Reuters. February 2020. Посетен на 2020-02-02.
  25. Limited data on coronavirus may be skewing assumptions about severity // STAT. Посетен на 2020-02-01. (на американски английски)
  26. Sparrow, Annie. How China's Coronavirus Is Spreading—and How to Stop It // Foreign Policy. Посетен на 2020-02-02. (на американски английски)
  27. Wuhan Coronavirus Death Rate - Worldometer // www.worldometers.info. Посетен на 2020-02-02. (на английски)
  28. Wang, Chen и др. A novel coronavirus outbreak of global health concern // The Lancet. 2020-01-24. DOI:10.1016/S0140-6736(20)30185-9. с. S0140673620301859. Архивиран от оригинала на 2 February 2020.
  29. WHOが"致死率3%程度" 専門家「今後 注意が必要」 // NHK, 24 January 2020. Архивиран от оригинала на 26 January 2020. Посетен на 3 February 2020.
  30. How does coronavirus spread? // NBC News. Посетен на 29 January 2020.
  31. Transmission of Novel Coronavirus (2019-nCoV) | CDC // www.cdc.gov. Посетен на 29 January 2020.
  32. Holshue, Michelle L. и др. First Case of 2019 Novel Coronavirus in the United States // New England Journal of Medicine. 2020-01-31. DOI:10.1056/NEJMoa2001191. с. NEJMoa2001191.
  33. Kupferschmidt, Kai. Study claiming new coronavirus can be transmitted by people without symptoms was flawed // Science. Посетен на 5 February 2020.
  34. Milligan, Gregg N., Barrett, Alan D. T. Vaccinology : an essential guide. Chichester, West Sussex, Wiley Blackwell, 2015. ISBN 978-1-118-63652-7. OCLC 881386962. с. 310.
  35. The Deceptively Simple Number Sparking Coronavirus Fears // The Atlantic. Посетен на 29 January 2020.
  36. Li, Qun и др. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia // New England Journal of Medicine. 29 January 2020. DOI:10.1056/NEJMoa2001316.
  37. Riou, Julien и др. Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019 novel coronavirus (2019-nCoV), December 2019 to January 2020 // Eurosurveillance 25 (4). 2020. DOI:10.2807/1560-7917.ES.2020.25.4.2000058.
  38. Liu, Tao и др. Transmission dynamics of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) // bioRxiv. 25 January 2020. DOI:10.1101/2020.01.25.919787. с. 2020.01.25.919787.
  39. Read, Jonathan M. и др. Novel coronavirus 2019-nCoV: early estimation of epidemiological parameters and epidemic predictions // MedRxiv. 28 January 2020. DOI:10.1101/2020.01.23.20018549. с. 2020.01.23.20018549.
  40. Saey, Tina Hesman. How the new coronavirus stacks up against SARS and MERS // Science News. Посетен на 3 February 2020.
  41. Myers, Steven Lee. China's Omnivorous Markets Are in the Eye of a Lethal Outbreak Once Again // The New York Times. 25 January 2020. Архивиран от оригинала на 26 January 2020.
  42. Eschner, Kat. We're still not sure where the Wuhan coronavirus really came from // Popular Science. Посетен на 2020-01-30.
  43. Wuhan Institue of Virology. Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin // bioRxiv. 23 January 2020. DOI:10.1101/2020.01.22.914952v2. с. 2020.01.22.914952. (BetaCoV/bat/Yunnan/RaTG13/2013; available on GISAID)
  44. Bat coronavirus isolate RaTG13, complete genome // {{{journal}}}. NCBI, 29 Jan 2020.
  45. Real-time tracking of influenza A/H3N2 evolution using data from GISAID // nextstrain.org.
  46. Zhu, Na и др. A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019 // New England Journal of Medicine 0. United States, 24 January 2020. DOI:10.1056/NEJMoa2001017.
  47. Phylogeny of SARS-like betacoronaviruses // nextstrain. Посетен на 18 January 2020.
  48. Initial genome release of novel coronavirus // Virological. Посетен на 12 January 2020.
  49. Wuhan seafood market pneumonia virus isolate Wuhan-Hu-1, complete genome // National Center for Biotechnology Information. United States, National Institutes of Health, 17 January 2020.
  50. Bedford, Trevor. Genomic epidemiology of novel coronavirus (nCoV) using data generated by Fudan University, China CDC, Chinese Academy of Medical Sciences, Chinese Academy of Sciences, Zhejiang Provincial Center for Disease Control and Prevention and the Thai National Institute of Health shared via GISAID // nextstrain.org. Посетен на 26 January 2020.
  51. China CDC developing novel coronavirus vaccine // Xinhua. Посетен на 28 January 2020.
  52. Chinese scientists race to develop vaccine as coronavirus death toll jumps // SCMP. Посетен на 28 January 2020.
  53. Cheung, Elizabeth. Hong Kong researchers have developed coronavirus vaccine, expert reveals // South China Morning Post. 28 January 2020. Архивиран от оригинала на 28 January 2020. Посетен на 28 January 2020.
  54. Cheung, Elizabeth. China coronavirus: Hong Kong researchers have already developed vaccine but need time to test it, expert reveals // South China Morning Post. Посетен на 1 February 2020. (на английски)
  55. Mazumdar, Tulip. Coronavirus: Scientists race to develop a vaccine // BBC News. Посетен на 2020-02-03. (на британски английски)
  56. Saskatchewan lab joins global effort to develop coronavirus vaccine // ca.news.yahoo.com. Посетен на 25 January 2020.
  57. Burley, Kay. "To get the vaccine into human studies would be about £1,500,000...to move it beyond that depends on how big the epidemic is." Imperial College's Prof Robin Shattock discusses the rush to develop a vaccine for coronavirus. JM #KayBurleypic.twitter.com/Pj1YABMufZ // @KayBurley. Посетен на 2020-01-30.
  58. Taylor-Coleman, Jasmine. How the new coronavirus will finally get a proper name // BBC, 5 February 2020. Посетен на 6 February 2020.

Допълнителна информация

  • World Health Organization (2020). Laboratory testing of human suspected cases of novel coronavirus (nCoV) infection: interim guidance, 10 January 2020 (Report). World Health Organization. hdl:10665/330374. WHO/2019-nCoV/laboratory/2020.1.
  • World Health Organization (2020). WHO R&D Blueprint: informal consultation on prioritization of candidate therapeutic agents for use in novel coronavirus 2019 infection, Geneva, Switzerland, 24 January 2020 (Report). World Health Organization. hdl:10665/330680. WHO/HEO/R&D Blueprint (nCoV)/2020.1.
  • Bender, Maddie. 'It’s a Moral Imperative:' Archivists Made a Directory of 5,000 Coronavirus Studies to Bypass Paywalls // vice.com. Посетен на 4 February 2020.
  • Habibzadeh, Parham и др. The Novel Coronavirus: A Bird's Eye View // The International Journal of Occupational and Environmental Medicine 11 (2). 2020-02-05. DOI:10.15171/ijoem.2020.1921. с. 65–71.

Външни връзки

Отворени хранилища за предпечат на достъп

(Предложена дума за търсене: „2019-nCoV“)

  • bioRxiv // The preprint server for biology (bioRxiv).
  • medRxiv // The preprint server for health sciences.
  • SSRN // Rapid worldwide dissemination of research.

Шаблон:Medical resources