РНК полимераза: Разлика между версии

от Уикипедия, свободната енциклопедия
Изтрито е съдържание Добавено е съдържание
м интервал
м [[: ---> [[
Ред 1: Ред 1:
'''РНК-полимераза''' е всеки [[:ензим]], който използва [[:АТФ]], [[:ГТФ]], [[:ЦТФ]] и [[:УТФ]] за синтезата на [[:РНК]] от [[:ДНК]] или РНК матрица.{{Br}}
'''РНК-полимераза''' е всеки [[ензим]], който използва [[АТФ]], [[ГТФ]], [[ЦТФ]] и [[УТФ]] за синтезата на [[РНК]] от [[ДНК]] или РНК матрица.{{Br}}
ДНК-зависими РНК полимерази включват ензимите на [[:транскрипция (биология)|транскрипцията]] на ДНК и [[:праймази]]те, които синтезират РНК зародишите, необходими за [[:репликация]]та.{{Br}}
ДНК-зависими РНК полимерази включват ензимите на [[транскрипция (биология)|транскрипцията]] на ДНК и [[праймази]]те, които синтезират РНК зародишите, необходими за [[репликация]]та.{{Br}}
РНК-зависима РНК полимераза участва в репликацията на [[:вирус]]ната РНК.{{Br}}
РНК-зависима РНК полимераза участва в репликацията на [[вирус]]ната РНК.{{Br}}
ДНК-зависимите катзлизират реакции между нуклеозид трифосфатите за формиране на РНК<sub>n+1</sub> от РНК<sub>n</sub> и [[:пирофосфат]].
ДНК-зависимите катзлизират реакции между нуклеозид трифосфатите за формиране на РНК<sub>n+1</sub> от РНК<sub>n</sub> и [[пирофосфат]].


=== Прокариотна РНК полимераза ===
=== Прокариотна РНК полимераза ===
В [[:прокариоти]]те има една единствена РНК полимераза, която транскрибира всички класове ДНК.
В [[прокариоти]]те има една единствена РНК полимераза, която транскрибира всички класове ДНК.


Същинската част на този ензим при [[:Escherichia coli]] е изградена от три типа субединици: 2'''α''',1'''β''' и 1'''β′'''. Тази сърцевина има афинитет към ДНК.{{Br}}
Същинската част на този ензим при [[Escherichia coli]] е изградена от три типа субединици: 2'''α''',1'''β''' и 1'''β′'''. Тази сърцевина има афинитет към ДНК.{{Br}}
Към ензима има допълнителна '''σ''' субединица ([[:сигма фактор]]), която участва в разпознаването на [[:промотор]]а на [[:ген]]а и инициацията на транскрипцията. Различни сигма фактори разпознават промоторите на различни гени.
Към ензима има допълнителна '''σ''' субединица ([[сигма фактор]]), която участва в разпознаването на [[промотор]]а на [[ген]]а и инициацията на транскрипцията. Различни сигма фактори разпознават промоторите на различни гени.


Сигма факторът е свързан в РНК полимеразния комплекс до разпознаването на съответния промотор, след което се отделя от ензима със започването на транскрипцията. {{Br}}
Сигма факторът е свързан в РНК полимеразния комплекс до разпознаването на съответния промотор, след което се отделя от ензима със започването на транскрипцията. {{Br}}
Функциите на останалите субединици не са напълно изяснени. За '''β''' се смята че участва в свързването на нуклеозидните субстрати. Именно тя се атакува от антибиотиците [[:рифамицин]] и [[:стрептолигидин]].
Функциите на останалите субединици не са напълно изяснени. За '''β''' се смята че участва в свързването на нуклеозидните субстрати. Именно тя се атакува от антибиотиците [[рифамицин]] и [[стрептолигидин]].


Субединицата '''β′'''(155kD)вероятно се свързва с [[:ДНК матрица]]та.{{Br}}
Субединицата '''β′'''(155kD)вероятно се свързва с [[ДНК матрица]]та.{{Br}}
Фаговите РНК полимерази са още по-просто устроени и често имат само една субединица с големина до 100kD.{{Br}}
Фаговите РНК полимерази са още по-просто устроени и често имат само една субединица с големина до 100kD.{{Br}}


=== Еукариотни РНК полимерази ===
=== Еукариотни РНК полимерази ===
[[:Еукариоти]]те имат три типа ДНК-зависима РНК полимераза в [[клетъчно ядро|ядрото]], всеки от които синтезира различен тип РНК.{{Br}}
[[Еукариоти]]те имат три типа ДНК-зависима РНК полимераза в [[клетъчно ядро|ядрото]], всеки от които синтезира различен тип РНК.{{Br}}
'''РНК полимераза I''' е локализирана в [[:ядърце]]то, транскрибира предшествениците на рРНК: 28S,18S и 5,8S. Има 13 субединици с обща [[:молекулна маса]] около 600kD.Разпознава един тип промотори и се нуждае от най-малко два допълнителни фактора. Ензимната ѝ активност в [[:клетка]]та е до 70% от общата полимеразна активност.{{Br}}
'''РНК полимераза I''' е локализирана в [[ядърце]]то, транскрибира предшествениците на рРНК: 28S,18S и 5,8S. Има 13 субединици с обща [[молекулна маса]] около 600kD.Разпознава един тип промотори и се нуждае от най-малко два допълнителни фактора. Ензимната ѝ активност в [[клетка]]та е до 70% от общата полимеразна активност.{{Br}}
'''РНК полимераза II''' се намира в [[:нуклеоплазмата]] и синтезира предшествениците на иРНК. Тя е изградена от две главни субединици от 215 и 139 кило [[:далтон]]а и няколко от по-малки [[:полипептид]]а. Първата по размер субединица е хомолог на '''β′''' от прокариотната РНК полимераза. Притежава „[[:домейн]] от карбоксилни опашки“, изграден от повтарящи се последователности от седем [[:аминокиселини]]. Участва в инициацията, при отделянето на РНК полимерза II от [[:преинициаторния комплекс]]. Втората по размер субединица е хомолог на '''β''' при прокариоти, а има и трета с много по-малки размери, която е хомоложна на '''α''' субединицата. Три от останалите субединици се срещат и при трите типа полимерази.{{Br}}
'''РНК полимераза II''' се намира в [[нуклеоплазмата]] и синтезира предшествениците на иРНК. Тя е изградена от две главни субединици от 215 и 139 кило [[далтон]]а и няколко от по-малки [[полипептид]]а. Първата по размер субединица е хомолог на '''β′''' от прокариотната РНК полимераза. Притежава „[[домейн]] от карбоксилни опашки“, изграден от повтарящи се последователности от седем [[аминокиселини]]. Участва в инициацията, при отделянето на РНК полимерза II от [[преинициаторния комплекс]]. Втората по размер субединица е хомолог на '''β''' при прокариоти, а има и трета с много по-малки размери, която е хомоложна на '''α''' субединицата. Три от останалите субединици се срещат и при трите типа полимерази.{{Br}}
'''РНК полимераза III''', също в нуклеоплазмата, отговаря за синтеза на предшествениците на рРНК 5S, тРНК и мяРНК. Разполага е 14 субединици и молекулна маса 700kD.{{Br}}
'''РНК полимераза III''', също в нуклеоплазмата, отговаря за синтеза на предшествениците на рРНК 5S, тРНК и мяРНК. Разполага е 14 субединици и молекулна маса 700kD.{{Br}}
Различните еукариотни РНК полимерази могат да бъдат разпознати благодарение на различната им чувствителност към [[:алфа-аматин]]. Първия клас ензими не се инхибира от този пептид, докато при втория клас се забелязва моментално ихибиране при ниска [[:концентрация]]. Третия клас има представители с различна чувствителност.
Различните еукариотни РНК полимерази могат да бъдат разпознати благодарение на различната им чувствителност към [[алфа-аматин]]. Първия клас ензими не се инхибира от този пептид, докато при втория клас се забелязва моментално ихибиране при ниска [[концентрация]]. Третия клас има представители с различна чувствителност.


== Източници ==
== Източници ==

Версия от 10:08, 9 декември 2018

РНК-полимераза е всеки ензим, който използва АТФ, ГТФ, ЦТФ и УТФ за синтезата на РНК от ДНК или РНК матрица.
ДНК-зависими РНК полимерази включват ензимите на транскрипцията на ДНК и праймазите, които синтезират РНК зародишите, необходими за репликацията.
РНК-зависима РНК полимераза участва в репликацията на вирусната РНК.
ДНК-зависимите катзлизират реакции между нуклеозид трифосфатите за формиране на РНКn+1 от РНКn и пирофосфат.

Прокариотна РНК полимераза

В прокариотите има една единствена РНК полимераза, която транскрибира всички класове ДНК.

Същинската част на този ензим при Escherichia coli е изградена от три типа субединици: 2α,1β и 1β′. Тази сърцевина има афинитет към ДНК.
Към ензима има допълнителна σ субединица (сигма фактор), която участва в разпознаването на промотора на гена и инициацията на транскрипцията. Различни сигма фактори разпознават промоторите на различни гени.

Сигма факторът е свързан в РНК полимеразния комплекс до разпознаването на съответния промотор, след което се отделя от ензима със започването на транскрипцията.
Функциите на останалите субединици не са напълно изяснени. За β се смята че участва в свързването на нуклеозидните субстрати. Именно тя се атакува от антибиотиците рифамицин и стрептолигидин.

Субединицата β′(155kD)вероятно се свързва с ДНК матрицата.
Фаговите РНК полимерази са още по-просто устроени и често имат само една субединица с големина до 100kD.

Еукариотни РНК полимерази

Еукариотите имат три типа ДНК-зависима РНК полимераза в ядрото, всеки от които синтезира различен тип РНК.
РНК полимераза I е локализирана в ядърцето, транскрибира предшествениците на рРНК: 28S,18S и 5,8S. Има 13 субединици с обща молекулна маса около 600kD.Разпознава един тип промотори и се нуждае от най-малко два допълнителни фактора. Ензимната ѝ активност в клетката е до 70% от общата полимеразна активност.
РНК полимераза II се намира в нуклеоплазмата и синтезира предшествениците на иРНК. Тя е изградена от две главни субединици от 215 и 139 кило далтона и няколко от по-малки полипептида. Първата по размер субединица е хомолог на β′ от прокариотната РНК полимераза. Притежава „домейн от карбоксилни опашки“, изграден от повтарящи се последователности от седем аминокиселини. Участва в инициацията, при отделянето на РНК полимерза II от преинициаторния комплекс. Втората по размер субединица е хомолог на β при прокариоти, а има и трета с много по-малки размери, която е хомоложна на α субединицата. Три от останалите субединици се срещат и при трите типа полимерази.
РНК полимераза III, също в нуклеоплазмата, отговаря за синтеза на предшествениците на рРНК 5S, тРНК и мяРНК. Разполага е 14 субединици и молекулна маса 700kD.
Различните еукариотни РНК полимерази могат да бъдат разпознати благодарение на различната им чувствителност към алфа-аматин. Първия клас ензими не се инхибира от този пептид, докато при втория клас се забелязва моментално ихибиране при ниска концентрация. Третия клас има представители с различна чувствителност.

Източници

„Oxford dictionary of Biochemistry and Molecular Biology“ revised edition, 2000