Хромозома 16

от Уикипедия, свободната енциклопедия
Нормален кариотип при човек с 22 двойки автозомни хромозоми и две полови хромозоми (гонозоми).

  Хромозома 16 е една от 23-те двойки хромозоми откриващи се при хората . В нормално състояние хората имат две копия на тази хромозома. Тя обхваща около 96 милиона базови двойки (строителният материал на ДНК) и представлява малко под 3% от общата ДНК намираща се в клетките .

Гени[редактиране | редактиране на кода]

Брой гени[редактиране | редактиране на кода]

По-долу са представени някои от гените разположени в хромозома 16. Тъй като учените използват различни подходи за определяне на броя на гените в генома, техните прогнози за броя им във всяка хромозома варира (за технически подробности вижте генното прогнозиране ). Сред различните проекти, проектът за съвместна консенсусна кодираща последователност (CCDS) използва изключително консервативна стратегия за тази цел. Така че прогнозата за броя на гените на CCDS представлява долна граница на общия брой гени, кодиращи човешки протеини. [1]

Оценено от Протеин кодиращи гени Некодиращи РНК гени Псевдогени Източник Дата на излизане
CCDS 795 [2] 2016-09-08
HGNC 802 251 365 [3] 2017-05-12
Ансамбл 865 1,046 462 [4] 2017-03-29
UniProt 838 [5] 2018-02-28
NCBI 912 652 502 [6] [7] [8] 2017-05-19

Болести и разстройства[редактиране | редактиране на кода]

Свързани черти[редактиране | редактиране на кода]

Цитогенетична лента (бенд)[редактиране | редактиране на кода]

G-бендинг на хромозома 16 в три различни резолюции (400,550 и 850). Дължината на бендовете е въз основа на идеограмите от ISCN (2013). Този тип идеограма показва реалния размер на бендовете, които се виждат под светлинен микроскоп през различните периоди на митотичното делене.
G-бендинг идиограма на хромозома 16 с резолюция 850 бенда. Дължината на бендовете в диаграмата е пропорционална на дължината на базовите двойки. Този тип идиограми обикновено се използват в геномните браузъри (Ensemble, UCSC,Genome browser).
G-bands of human chromosome 16 in resolution 850 bphs
Хромозома Рамо Бенд ISCN

start
ISCN

stop[11]
Базови двойки

начало

Базови двойки

край

Оцветяване Density
16 p 13.3 0 352 1 7,800,000 gneg
16 p 13.2 352 596 7,800,001 10,400,000 gpos 50
16 p 13.13 596 813 10,400,001 12,500,000 gneg
16 p 13.12 813 948 12,500,001 14,700,000 gpos 50
16 p 13.11 948 1070 14,700,001 16,700,000 gneg
16 p 12.3 1070 1246 16,700,001 21,200,000 gpos 50
16 p 12.2 1246 1409 21,200,001 24,200,000 gneg
16 p 12.1 1409 1558 24,200,001 28,500,000 gpos 50
16 p 11.2 1558 1856 28,500,001 35,300,000 gneg
16 p 11.1 1856 2045 35,300,001 36,800,000 acen
16 q 11.1 2045 2194 36,800,001 38,400,000 acen
16 q 11.2 2194 2709 38,400,001 47,000,000 gvar
16 q 12.1 2709 2953 47,000,001 52,600,000 gneg
16 q 12.2 2953 3142 52,600,001 56,000,000 gpos 50
16 q 13 3142 3346 56,000,001 57,300,000 gneg
16 q 21 3346 3657 57,300,001 66,600,000 gpos 100
16 q 22.1 3657 4023 66,600,001 70,800,000 gneg
16 q 22.2 4023 4118 70,800,001 72,800,000 gpos 50
16 q 22.3 4118 4294 72,800,001 74,100,000 gneg
16 q 23.1 4294 4551 74,100,001 79,200,000 gpos 75
16 q 23.2 4551 4659 79,200,001 81,600,000 gneg
16 q 23.3 4659 4768 81,600,001 84,100,000 gpos 50
16 q 24.1 4768 4930 84,100,001 87,000,000 gneg
16 q 24.2 4930 5025 87,000,001 88,700,000 gpos 25
16 q 24.3 5025 5120 88,700,001 90,338,345 gneg

Бележки[редактиране | редактиране на кода]

  1. Pertea M, Salzberg SL. Between a chicken and a grape: estimating the number of human genes. // Genome Biol 11 (5). 2010. DOI:10.1186/gb-2010-11-5-206. с. 206.
  2. Search results – 16[CHR] AND „Homo sapiens“[Organism] AND („has ccds“[Properties] AND alive[prop]) – Gene. // NCBI. Посетен на 2017-05-28.
  3. Statistics & Downloads for chromosome 16. // HUGO Gene Nomenclature Committee. Посетен на 2017-05-19.
  4. Chromosome 16: Chromosome summary – Homo sapiens. // Ensembl Release 88. Посетен на 2017-05-19.
  5. Human chromosome 16: entries, gene names and cross-references to MIM. // UniProt. Посетен на 2018-03-16.
  6. Search results – 16[CHR] AND „Homo sapiens“[Organism] AND („genetype protein coding“[Properties] AND alive[prop]) – Gene. // NCBI. Посетен на 2017-05-20.
  7. Search results – 16[CHR] AND „Homo sapiens“[Organism] AND ( („genetype miscrna“[Properties] OR „genetype ncrna“[Properties] OR „genetype rrna“[Properties] OR „genetype trna“[Properties] OR „genetype scrna“[Properties] OR „genetype snrna“[Properties] OR „genetype snorna“[Properties]) NOT „genetype protein coding“[Properties] AND alive[prop]) – Gene. // NCBI. Посетен на 2017-05-20.
  8. Search results – 16[CHR] AND „Homo sapiens“[Organism] AND („genetype pseudo“[Properties] AND alive[prop]) – Gene. // NCBI. Посетен на 2017-05-20.
  9. Maillard, A M. The 16p11.2 locus modulates brain structures common to autism, schizophrenia and obesity. // Molecular Psychiatry 20 (1). 25 November 2014. DOI:10.1038/mp.2014.145. с. 140 – 147.
  10. Richter, M. Altered TAOK2 activity causes autism-related neurodevelopmental and cognitive abnormalities through RhoA signaling. // Molecular Psychiatry 24 (9). 21 February 2018. DOI:10.1038/s41380-018-0025-5. с. 1329 – 1350.
  11. These values (ISCN start/stop) are based on the length of bands/ideograms from the ISCN book, An International System for Human Cytogenetic Nomenclature (2013). //
CC BY-SA icon.svg Heckert GNU white.png Тази страница частично или изцяло представлява превод на страницата Chromosome 16 в Уикипедия на английски. Оригиналният текст, както и този превод, са защитени от Лиценза „Криейтив Комънс – Признание – Споделяне на споделеното“, а за съдържание, създадено преди юни 2009 година – от Лиценза за свободна документация на ГНУ. Прегледайте историята на редакциите на оригиналната страница, както и на преводната страница, за да видите списъка на съавторите. ​

ВАЖНО: Този шаблон се отнася единствено до авторските права върху съдържанието на статията. Добавянето му не отменя изискването да се посочват конкретни източници на твърденията, които да бъдат благонадеждни.​